MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 2542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	GAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775796
2	NC_016814	AGAA	2	8	1209	1216	75 %	0 %	25 %	0 %	378775796
3	NC_016814	CCT	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775796
4	NC_016814	GCCA	2	8	1298	1305	25 %	0 %	25 %	50 %	378775796
5	NC_016814	ATCG	2	8	1349	1356	25 %	25 %	25 %	25 %	378775796
6	NC_016814	AGC	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775796
7	NC_016814	GTG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775796
8	NC_016814	TCG	2	6	1459	1464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
9	NC_016814	TGA	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775796
10	NC_016814	GAA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775796
11	NC_016814	TCG	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
12	NC_016814	GTGC	2	8	1605	1612	0 %	25 %	50 %	25 %	378775796
13	NC_016814	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775796
14	NC_016814	GTCG	2	8	1793	1800	0 %	25 %	50 %	25 %	378775796
15	NC_016814	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775796
16	NC_016814	CG	3	6	1860	1865	0 %	0 %	50 %	50 %	378775796
17	NC_016814	AGC	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775796
18	NC_016814	CGG	2	6	1928	1933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775796
19	NC_016814	CTG	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
20	NC_016814	AGA	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775796
21	NC_016814	CGT	2	6	2105	2110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
22	NC_016814	CCAA	2	8	2120	2127	50 %	0 %	0 %	50 %	378775796
23	NC_016814	AAC	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775796
24	NC_016814	GAC	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775797
25	NC_016814	GCG	2	6	2442	2447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
26	NC_016814	CGG	2	6	2510	2515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
27	NC_016814	CG	3	6	2575	2580	0 %	0 %	50 %	50 %	378775797
28	NC_016814	GCT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
29	NC_016814	GAG	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
30	NC_016814	TCG	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
31	NC_016814	CG	3	6	2680	2685	0 %	0 %	50 %	50 %	378775797
32	NC_016814	GCG	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
33	NC_016814	CGC	2	6	2721	2726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775797
34	NC_016814	TCG	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
35	NC_016814	GCG	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
36	NC_016814	GAG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
37	NC_016814	GCT	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
38	NC_016814	GCA	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775797
39	NC_016814	GGC	2	6	2883	2888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
40	NC_016814	AGG	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
41	NC_016814	GAG	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
42	NC_016814	TGC	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
43	NC_016814	TGC	2	6	3153	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
44	NC_016814	CGA	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775797
45	NC_016814	TGC	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
46	NC_016814	GGT	2	6	3381	3386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775797
47	NC_016814	AGG	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
48	NC_016814	CGC	3	9	3456	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775797
49	NC_016814	CAA	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775797
50	NC_016814	CGG	2	6	3510	3515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
51	NC_016814	CAT	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775798
52	NC_016814	ATCA	2	8	4106	4113	50 %	25 %	0 %	25 %	378775798
53	NC_016814	GAG	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775798
54	NC_016814	CGG	2	6	4529	4534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775798
55	NC_016814	TGG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775798
56	NC_016814	ATTC	2	8	4679	4686	25 %	50 %	0 %	25 %	378775799
57	NC_016814	GCAGAA	2	12	4760	4771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378775799
58	NC_016814	TGC	2	6	4790	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775799
59	NC_016814	TGG	2	6	4961	4966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775799
60	NC_016814	AAG	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775799
61	NC_016814	TTC	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775799
62	NC_016814	CTT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775799
63	NC_016814	AGC	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775799
64	NC_016814	TTG	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775799
65	NC_016814	AGC	2	6	5309	5314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775799
66	NC_016814	CG	3	6	5324	5329	0 %	0 %	50 %	50 %	378775799
67	NC_016814	GAG	2	6	5584	5589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775800
68	NC_016814	GC	3	6	5596	5601	0 %	0 %	50 %	50 %	378775800
69	NC_016814	CCAT	2	8	5612	5619	25 %	25 %	0 %	50 %	378775800
70	NC_016814	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775800
71	NC_016814	TAT	2	6	5668	5673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378775800
72	NC_016814	GGA	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775800
73	NC_016814	AGA	2	6	5813	5818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775800
74	NC_016814	TCA	2	6	5837	5842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775800
75	NC_016814	AGC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775800
76	NC_016814	GAT	3	9	5875	5883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775800
77	NC_016814	GAT	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775800
78	NC_016814	GGA	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775800
79	NC_016814	GTC	2	6	6114	6119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775800
80	NC_016814	CGA	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775801
81	NC_016814	GTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775801
82	NC_016814	TCT	2	6	6470	6475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775801
83	NC_016814	TCG	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775801
84	NC_016814	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775801
85	NC_016814	GTC	2	6	6832	6837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775801
86	NC_016814	AAC	2	6	6970	6975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775801
87	NC_016814	ATG	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
88	NC_016814	CGT	2	6	7020	7025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
89	NC_016814	TCG	2	6	7085	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
90	NC_016814	G	6	6	7126	7131	0 %	0 %	100 %	0 %	378775802
91	NC_016814	GCA	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
92	NC_016814	TCT	2	6	7181	7186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775802
93	NC_016814	AT	3	6	7303	7308	50 %	50 %	0 %	0 %	378775802
94	NC_016814	CGG	2	6	7473	7478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
95	NC_016814	CAG	2	6	7540	7545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
96	NC_016814	TCGG	2	8	7553	7560	0 %	25 %	50 %	25 %	378775802
97	NC_016814	CGG	2	6	7563	7568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
98	NC_016814	GC	3	6	7574	7579	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
99	NC_016814	GAA	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775802
100	NC_016814	GA	3	6	7643	7648	50 %	0 %	50 %	0 %	378775802
101	NC_016814	GGTC	2	8	7687	7694	0 %	25 %	50 %	25 %	378775802
102	NC_016814	CT	3	6	7796	7801	0 %	50 %	0 %	50 %	378775802
103	NC_016814	AGG	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775802
104	NC_016814	TCGG	2	8	7974	7981	0 %	25 %	50 %	25 %	378775802
105	NC_016814	GCG	2	6	8039	8044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
106	NC_016814	TGA	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
107	NC_016814	CGG	2	6	8191	8196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
108	NC_016814	GATC	2	8	8221	8228	25 %	25 %	25 %	25 %	378775802
109	NC_016814	TC	3	6	8232	8237	0 %	50 %	0 %	50 %	378775802
110	NC_016814	CGA	2	6	8295	8300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
111	NC_016814	GCC	2	6	8411	8416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
112	NC_016814	CTT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775802
113	NC_016814	GC	3	6	8443	8448	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
114	NC_016814	GAA	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775802
115	NC_016814	GCG	2	6	8563	8568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
116	NC_016814	CG	3	6	8573	8578	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
117	NC_016814	CGG	2	6	8635	8640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
118	NC_016814	GCC	2	6	8789	8794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
119	NC_016814	CGC	2	6	8809	8814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
120	NC_016814	TTG	2	6	8831	8836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775802
121	NC_016814	CCG	2	6	8900	8905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
122	NC_016814	GC	3	6	8909	8914	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
123	NC_016814	GCC	2	6	8922	8927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
124	NC_016814	CGA	2	6	8937	8942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
125	NC_016814	CGA	2	6	8970	8975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
126	NC_016814	CGG	2	6	9072	9077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
127	NC_016814	CTG	2	6	9094	9099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
128	NC_016814	TGA	2	6	9111	9116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
129	NC_016814	GAACCG	2	12	9136	9147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
130	NC_016814	GGCCCT	2	12	9156	9167	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378775802
131	NC_016814	GGA	2	6	9207	9212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775802
132	NC_016814	GTC	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
133	NC_016814	GTC	2	6	9361	9366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
134	NC_016814	AAG	2	6	9371	9376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775802
135	NC_016814	ACG	2	6	9405	9410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
136	NC_016814	CG	3	6	9447	9452	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
137	NC_016814	GGC	2	6	9552	9557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
138	NC_016814	GGC	2	6	9622	9627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
139	NC_016814	AGT	2	6	9641	9646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
140	NC_016814	CGT	2	6	9690	9695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
141	NC_016814	GAGGC	2	10	9708	9717	20 %	0 %	60 %	20 %	378775802
142	NC_016814	GTG	2	6	9765	9770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775802
143	NC_016814	TCC	2	6	9812	9817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775802
144	NC_016814	GGTG	2	8	9820	9827	0 %	25 %	75 %	0 %	378775802
145	NC_016814	TGG	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775802
146	NC_016814	CGGCGT	2	12	9882	9893	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378775802
147	NC_016814	CG	3	6	9922	9927	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
148	NC_016814	GC	3	6	9931	9936	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
149	NC_016814	CG	3	6	10081	10086	0 %	0 %	50 %	50 %	378775803
150	NC_016814	GCC	2	6	10152	10157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775803
151	NC_016814	GCA	2	6	10214	10219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775803
152	NC_016814	TCG	2	6	10243	10248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775803
153	NC_016814	GAAC	2	8	10317	10324	50 %	0 %	25 %	25 %	378775803
154	NC_016814	GGA	2	6	10449	10454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775803
155	NC_016814	GGC	2	6	10468	10473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775803
156	NC_016814	CGG	2	6	10495	10500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775803
157	NC_016814	ATG	2	6	10829	10834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775804
158	NC_016814	GC	3	6	10894	10899	0 %	0 %	50 %	50 %	378775804
159	NC_016814	GCG	2	6	10907	10912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775804
160	NC_016814	GCTCGC	2	12	11056	11067	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378775804
161	NC_016814	ACC	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775804
162	NC_016814	TTC	2	6	11147	11152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775804
163	NC_016814	CAG	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775804
164	NC_016814	GGC	2	6	11218	11223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775804
165	NC_016814	GGC	2	6	11230	11235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775804
166	NC_016814	AAG	2	6	11240	11245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775804
167	NC_016814	TGAC	2	8	11265	11272	25 %	25 %	25 %	25 %	378775804
168	NC_016814	GCC	2	6	11444	11449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775805
169	NC_016814	CTT	2	6	11479	11484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775805
170	NC_016814	CAT	2	6	11492	11497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775805
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172	NC_016814	CTT	2	6	11581	11586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775805
173	NC_016814	GCG	2	6	11608	11613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775805
174	NC_016814	CTCG	2	8	11701	11708	0 %	25 %	25 %	50 %	378775805
175	NC_016814	CG	3	6	11779	11784	0 %	0 %	50 %	50 %	378775805
176	NC_016814	CATC	2	8	11812	11819	25 %	25 %	0 %	50 %	378775805
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179	NC_016814	CTTA	2	8	12337	12344	25 %	50 %	0 %	25 %	378775806
180	NC_016814	TTGT	2	8	12386	12393	0 %	75 %	25 %	0 %	378775807
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182	NC_016814	GGC	2	6	12480	12485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775807
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230	NC_016814	GCG	3	9	15166	15174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775811
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243	NC_016814	GCA	2	6	15812	15817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775811
244	NC_016814	G	6	6	15884	15889	0 %	0 %	100 %	0 %	378775811
245	NC_016814	CATGCC	2	12	15906	15917	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378775811
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247	NC_016814	GAAATG	2	12	16023	16034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378775811
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249	NC_016814	CGAG	2	8	16126	16133	25 %	0 %	50 %	25 %	378775811
250	NC_016814	ACG	2	6	16150	16155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775811
251	NC_016814	CAT	2	6	16208	16213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775811
252	NC_016814	GTG	2	6	16252	16257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775811
253	NC_016814	TCG	2	6	16259	16264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775811
254	NC_016814	GAA	2	6	16460	16465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775811
255	NC_016814	CGGT	2	8	16494	16501	0 %	25 %	50 %	25 %	378775811
256	NC_016814	CGGA	2	8	16515	16522	25 %	0 %	50 %	25 %	378775811
257	NC_016814	CGA	2	6	16526	16531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775811
258	NC_016814	TGG	2	6	16576	16581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775811
259	NC_016814	AGC	2	6	16591	16596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775811
260	NC_016814	ACG	2	6	16660	16665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775811
261	NC_016814	TGT	2	6	16700	16705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775811
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264	NC_016814	ATCG	2	8	16911	16918	25 %	25 %	25 %	25 %	378775811
265	NC_016814	GC	3	6	16958	16963	0 %	0 %	50 %	50 %	378775811
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383	NC_016814	AAC	2	6	23276	23281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775819
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386	NC_016814	CGT	2	6	23374	23379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775819
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389	NC_016814	GGAT	2	8	23526	23533	25 %	25 %	50 %	0 %	378775820
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499	NC_016814	CGC	2	6	32076	32081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775827
500	NC_016814	GAAGA	2	10	32151	32160	60 %	0 %	40 %	0 %	378775827

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